Lietuvos vyskupų konferencijoje veikia švietimo, visuomenės informavimo priemonių, liturgijos ir vienuolijų reikalų vyskupiškosios komisijos.
Komisijų pirmininkus trejų metų laikotarpiui iš savo narių renka Konferencija. Kitus komisijos narius, komisijos pirmininkui pasiūlius, trejų metų laikotarpiui skiria Konferencijos plenarinis posėdis. Komisijos gali pasitelkti pagalbon atitinkamos srities specialistus.
Komisijos rengia jų kompetencijai tenkančius klausimus svarstyti plenariniame posėdyje.
LVK Liturgijos komisija
Pirmininkas: vyskupas Rimantas NORVILA.
LVK Švietimo komisija
Pirmininkas: vyskupas Algirdas JUREVIČIUS.
LVK Visuomenės informavimo priemonių komisija
Pirmininkas: vyskupas Saulius BUŽAUSKAS.
LVK Vienuolijų reikalų komisija
Pirmininkas: vyskupas Linas VODOPJANOVAS OFM.